本局研究報告：

96年度
◎我國非營利事業適用所得稅租稅獎勵之探討
◎兩岸移轉訂價查核之研究─兼論對臺商影響

95年度
◎股利他益信託之權利價值計算研究

94年度
◎衍生性金融商品課稅之探討
◎個人捐贈衍生逃漏稅問題之探討

93年度
◎國稅激勵制度（含查稅獎金）對稽徵人員工作動機之影響
◎探討公設地捐贈所隱含之相關逃漏稅及其查核

92年度
◎綜合所得稅稽徵程序委外承包之可行性

91年度
◎兩稅合一課稅制度之檢討及改進意見
◎信託稅法稽徵實務之探討
◎國稅稽徵機關服務品質之實證研究

90年度
◎如何暢通復查業務流程之研究
◎租稅獎勵措施對營利事業稅負的影響